يضم مجلس الأمناء مجموعة أصحاب المصلحة المتعددين ويشرف على تنفيذ معايير المبادرة ويحدد الأهداف التي تعكس الأولويات الوطنية لإدارة قطاعات النفط والغاز والتعدين.

يتكون مجلس الأمناء من رئيس المجلس ونائب الرئيس وستة عشر عضواً يختارون لأربع سنوات قابلة للتمديد أو التجديد مع مراعاة التوازن النوعي بين الجنسين، وكما مبين في أدناه:

1. تسمية السيد وزير النفط رئيساً لمجلس الأمناء.

2. تسمية المدير التنفيذي نائباً للرئيس إضافةً إلى منصبه.

3. ستة أعضاء يمثلون الجهات الحكومية بدرجة مدير عام فما فوق ترشحهم وزارات (التخطيط والنفط، والمالية، والصناعة والمعادن)، والأمانة العامة لمجلس الوزراء، والبنك المركزي العراقي.

4. خمسة أعضاء يمثلون الصناعة الاستخراجية (قطاعات النفط، والغاز، والتعدين)، على أن يمثل الشركات العالمية العاملة في جمهورية العراق عضوان بدرجة المدير الإقليمي أو مدير الفرع، ويمثل الشركات العامة المملوكة لوزارة النفط عضوان بدرجة مدير عام ويمثل الشركات العامة المملوكة لوزارة الصناعة والمعادن عضو واحد بدرجة مدير عام.

5. خمسة أعضاء يمثلون مكونات المجتمع المدني على أن يمثل المنظمات غير الحكومية ثلاثة أعضاء بدرجة (رئيس المنظمة) يُختارون من بين مرشحي المنظمات المجازة أصولياً بموجب قانون المنظمات غير الحكومية (١٢ لسنة ٢٠١٠) ويمثل الاتحادات والنقابات المهنية المسجلة رسمياً بموجب القانون عضوان بدرجة النقيب أو رئيس الاتحاد.